Los datos e información sobre la biodiversidad colombiana contienen detalles taxonómicos, geográficos e históricos únicos, recopilados durante años por investigadores y diversos actores a través de observaciones o recolecciones de organismos en nuestro país. Su registro ofrece múltiples posibilidades para resolver preguntas provenientes de la sociedad, pero a veces son de acceso limitado o están en formatos difíciles de interpretar o de conectar a otras fuentes e iniciativas.
Aprovechando los avances tecnológicos, cada vez más organizaciones públicas y privadas buscan compartir dichos datos e información a través de procesos más robustos y con mejores posibilidades de acceso. Para ello, el SiB Colombia facilita la publicación de conjuntos de datos (registros biológicos, eventos de muestreo, listas de chequeo) e información (fichas de especies) a organizaciones (o personas autorizadas por estas), usando estándares internacionalmente aceptados. Esto garantiza la calidad y el acceso a lo que se publica, sin cerrar las puertas a iniciativas de ciencia participativa (como las de monitoreo comunitario), en las que sus integrantes pueden compartir sus observaciones a través de organizaciones que publican sus datos por medio del SiB Colombia.
Los tipos de datos o información definen la ruta para continuar. Para identificarla es importante que te hagas las siguientes dos preguntas:
¿Qué tipo de conjuntos de datos o información deseo publicar?
¿Cuál es el motivo de mi publicación?
Descubre los beneficios de publicar datos abiertos sobre biodiversidad
Una parte importante de la misión del SiB Colombia es promover una cultura en el que todas las personas reconozcan los beneficios de publicar datos abiertos sobre biodiversidad, tanto para quien los publica, como para la sociedad en general. Por esto, la publicación de datos:
- Promueve la visibilidad y reconocimiento de las personas y organizaciones que generan y hacen curaduría de datos o información sobre biodiversidad.
- Amplía el reconocimiento ante la comunidad académica a autores de artículos de datos revisados por pares a partir de datos abiertos.
- Contribuye al conocimiento global sobre la biodiversidad y, por tanto, a las soluciones que promueven su cuidado y uso sostenible, al hacer que tus datos sean accesibles a través del SiB Colombia y plataformas como GBIFstrong> u OBIS.
- Facilita nuevas oportunidades de colaboración a través de la integración de conjuntos de datos en todo el mundo, entre los propietarios de los datos y otros investigadores o actores.
- Permite rastrear el uso y las citas de los conjuntos de datos publicados y a los que se accede a través del SiB Colombia e infraestructuras similares (GBIF, OBIS).
- Impulsa oportunidades con agencias financiadoras que ahora exigen que los investigadores y organizaciones que reciben sus fondos cuenten con un plan de gestión de datos que incluya su publicación abierta al final de un proyecto, a través de plataformas como el SiB Colombia.
- Contribuye a las Metas Kunming - Montreal del CDB, facilitando datos, información y conocimientos para la toma de decisiones (Meta 21) e, indirectamente, apoyando las metas 1 (sobre áreas clave para la biodiversidad, KBA), 2 (restauración de ecosistemas), 3 (monitoreo de áreas protegidas), 4 (recuperación y conservación de especies), 6 (control de especies invasoras) y 15 (regulación de impactos empresariales en la biodiversidad).
- Aporta a la evaluación de los ODS 14 (Vida submarina) y 15 (Vida de ecosistemas terrestres).
- Permite la construcción de modelos y evaluaciones de la biodiversidad a diferentes escalas, por parte de instancias intergubernamentales como GEO-BON e IPBES.
- Contribuye al Acuerdo de Escazú, ratificado en la Ley 2273 de 2022, que busca facilitar el acceso a la información, la participación pública y el acceso a la justicia en asuntos ambientales.
En este punto, de acuerdo a tu interés, puedes continuar en esta página con el paso a paso para la publicación de conjuntos de datos, ó:
Ir a la guía de publicación de fichas de especies |
Publicar conjuntos de datos
Esta es la ruta de publicación usada para compartir registros biológicos, eventos de muestreo y listas de chequeo El Equipo Coordinador del SiB Colombia ofrece un acompañamiento para la publicación exitosa de los datos, asegurando que los conjuntos de datos cuenten con la mayor calidad posible.
1. Registra tu organización
Para comenzar a publicar tus datos, tu organización debe registrarse una única vez como “socio publicador de datos” del SiB Colombia. Verifica si tu organización ya se encuentra registrada como publicador aquí. Si tu organización ya está registrada, debes acercarte a uno de los contactos allí guardados para obtener información sobre la publicación de tus datos. En caso contrario, para registrarse, tu organización debe:
- Revisar la política de publicación y estar de acuerdo en compartir tus datos.
- Informar a las directivas de tu organización sobre la importancia de ser un publicador del SiB Colombia y los beneficios para la organización. Es desde esa instancia que una organización toma la decisión de ser publicadora.
- De ser positiva la decisión, debe solicitarse el registro de la organización en el SiB Colombia como publicador de datos e información. La respuesta sobre la aprobación se realiza en línea.
2. Prepara los datos para la publicación
Tus datos deben ser organizados en una estructura de tabla utilizando el estándar Darwin Core (DwC). Para familiarizarte con el formato, puedes utilizar las plantillas Excel creadas para registros biológicos, eventos de muestreo, listas de chequeo y extensiones.
También puedes crear tu propia plantilla de manera manual usando la documentación del estándar Darwin Core adaptada al español disponible aquí.
Consulta la guía práctica de estandarización de datos en Darwin Core |
3. Valida la calidad de los datos estandarizados
Puedes validar la calidad del conjunto de datos antes de publicarlo usando la herramienta GBIF Data Validator, que te entrega una serie recomendaciones específicas para mejorarlos y limpiarlos. Este reporte te ayudará a identificar datos duplicados, campos incompletos e inconsistencias en el formato.
4. Solicita un acompañamiento para la publicación
El SiB Colombia está atento para ayudarte a asegurar que tus conjuntos de datos cuenten con la mayor calidad posible antes de ser publicados. Para ello, después de finalizar la preparación de tu conjunto de datos y realizar las correcciones de calidad, debes ponerte en contacto con el Equipo Coordinador a través del correo electrónico sib@humboldt.org.co solicitando un acompañamiento para la publicación.
Si tu conjunto de datos cuenta con datos relacionados como rasgos funcionales, referencias bibliográficas, secuencias genéticas, imágenes, vídeo, sonidos, entre otros, y deseas que hagan parte de la publicación, recuerda estandarizar los datos utilizando las plantillas y los elementos del estándar disponibles en la página web, además de mencionarlo en el correo, el Equipo Coordinador te apoyará en la los ajustes de estos datos adicionales o a estructurarlos en caso de ser necesario.
Recuerda que los acompañamientos en el SiB Colombia se atienden en orden de llegada. Los tiempos de respuesta pueden variar dependiendo de la demanda o la complejidad de los datos.
Conoce el modelo de correo electrónico recomendado
Asunto: Publicación conjunto de datos – [nombre de la organización publicadora]Apreciado Equipo Coordinador,
Mi nombre es
[nombre de la persona encargada de la publicación]
, trabajo para [nombre de la organización publicadora] y deseo solicitar un acompañamiento para la publicación de un conjunto de datos que previamente preparé y validé siguiendo las instrucciones del modelo de publicación de datos del SiB Colombia.El conjunto de datos que deseamos publicar corresponde a…
[una breve descripción del conjunto de datos que será publicado. Debe proveer suficiente información para ayudar al Equipo Coordinador a entender su conjunto de datos y la forma en que fueron generados]
.Adjunto el conjunto de datos en formato
[Excel, TXT o CSV]
y quedo atento a los próximos pasos.Saludo cordial,
[nombre de la persona encargada de la publicación]
5. Inicia el acompañamiento para la publicación
A partir de la solicitud de acompañamiento enviada, un asesor del Equipo Coordinador del SiB Colombia se pone en contacto contigo y te ofrece el apoyo necesario para la publicación, compartiendo las credenciales para que puedas documentar los metadatos mientras que el EC-SiB realiza la revisión detallada del conjunto de datos que enviaste.
Luego de la revisión, se genera y envía un correo con un reporte de calidad que tiene sugerencias y recomendaciones, que pueden incluir indicaciones sobre vacíos en los datos, inconsistencias o problemas de calidad. Estos deben ser corregidos para continuar con la publicación cuanto antes.
Además de realizar los ajustes solicitados en el conjunto de datos, ten en cuenta que durante el proceso también debes avanzar con la documentación de los metadatos en la sección Metadatos de la plataforma.
Ver detalles sobre la documentación de los metadatos
Debes realizar la documentación a través de la URL y credenciales que te compartieron en el correo de apertura, considerando toda la información que da contexto a tus datos. En total hay 12 secciones. Cuando hayas completado los metadatos, responde el correo del asesor del Equipo Coordinador indicando que has finalizado la documentación.
Además, todos los publicadores de datos deben elegir entre las opciones preestablecidas de licencias y herramientas Creative Commons, que determinará la forma como los comparten y las condiciones que imponen a los usuarios que los reutilicen.
Ver opciones de licencias Creative Commons
CC0, permite cualquier uso sin restricciones, incluso con fines comerciales.
CC BY, permite cualquier uso, incluso con fines comerciales, siempre que te sea reconocida la autoría de la publicación.
CC BY-NC, permite al público cualquier uso no comercial, siempre que te sea reconocida la autoría de la publicación.
El profesional del Equipo Coordinador revisa la documentación de metadatos y te informa si debes realizar ajustes. El proceso de acompañamiento es iterativo, es decir que el conjunto de datos y sus metadatos asociados pueden contar con varias revisiones antes de ser publicado, hasta que cuenten con todos los mínimos de calidad.
Consulta el vídeo sobre cómo documentar metadatos en el IPT
6. Publicación del conjunto de datos
Cuando el conjunto de datos y sus metadatos se encuentran listos, se procede a su publicación. El asesor del Equipo Coordinador del SiB Colombia asigna un Identificador Único Digital (DOI) al conjunto de datos y realiza el registro del mismo en GBIF. Al finalizar el proceso, recibes un correo electrónico con la notificación de la publicación exitosa y los enlaces donde puede ser consultado.